Từ 1996 đến 2009, công ty có tên là AdventNet, Inc. Năm 2009, công ty đổi tên thành Zoho Corporation cùng với bộ ứng dụng văn phòng trực tuyến cùng tên.[3] Công ty ra mắt và phát triển mà không cần tài trợ bên ngoài và thuộc sở hữu tư nhân.

AdventNet đã mở rộng hoạt động sang Nhật Bản vào tháng 6/2001.

Zoho CRM được phát hành năm 2005, sau đó là các phiên bản Projects, Creator và Sheet năm 2006.

Zoho đã mở rộng vào không gian cộng tác với việc phát hành Zoho Docs và Zoho Meeting năm 2007. Năm 2008, công ty đã thêm các ứng dụng hóa đơn và thư, và tuyên bố đã đạt được 1 triệu người dùng vào tháng 8 năm đó.

Hội nghị người dùng Zoho lần đầu tiên, Zoholics, đã được ra mắt vào năm 2012.

Mỗi năm kể từ năm 2005, Zoho phát hành thêm các ứng dụng và năm 2017 đã phát hành Zoho One, một bộ toàn diện của tất cả các Zoho Applications.[4]